O Programa de Pós-Graduação em Física – PFI têm por objetivo a formação de pesquisadores e docentes nas diversas áreas da física. Desde 1997 o PFI da UEM já formou mais de 162 mestres, e mais de 70 doutores. Entre os pontos fortes do programa se destaca a produtividade com ampla participação dos estudantes nas publicações científicas e a interdisciplinaridade do trabalhos. Nas últimas avaliações trienais da CAPES, o programa obteve nota 5. O programa hoje é composto de um corpo docente de 17 professores permanentes, com a maioria sendo pesquisadores do CNPq, atuando ativamente em 37 diferentes linhas de pesquisa, tanto teóricas quanto experimentais, distribuídos em 8 grupos de pesquisa. O programa tem se destacado como um dos melhores do estado e com ótima repercussão nacional e internacional. Docentes e alunos têm a sua disposição uma moderna infraestrutura de laboratórios de pesquisa, em adição da possibilidade de utilização de diversos outros laboratórios institucionais multiusuários, proporcionando aos acadêmicos a oportunidade de desenvolver seus trabalhos com uma infra-estrutura adequada, com a utilização de tecnologias inovadoras.